Все находящиеся на территории Горного Алтая археологические памятники относятся к одному из периодов:

каменный век (1 млн. — 4 тыс. лет до н.э.);

бронзовый век (4 тыс. —1 тыс. до н.э.);

железный век (1 тыс. до н.э — 5 в. н.э.);

тюркский период (6-10 вв.).

К каменному веку относится самая древняя стоянка первобытных людей на территории Республики Алтай — уникальный памятник Улалинка, расположенный в Горно-Алтайске. В результате раскопок были обнаружены следы жизнедеятельности древнего человека в пределах 1-1,5 млн лет назад. Также к каменному веку относятся раскопки пещер и стоянок возле них: Денисовой, Усть-Канской и других.

Каменный век сменяет эпоха палеометалла. Первым металлом, используемым алтайцами, была медь, позже появилась бронза. Медь и бронза широко использовались для изготовления украшений, оружия, предметов быта. Археологические памятники того времени относятся к афанасьевской и каракольской культурам. Это могильники Ело, Ело-Баши, Первый Межелик, Кара-Коба и многие другие.

В 1 тыс. до н.э. период бронзы сменяется в Горном Алтае периодом раннего железа. Расцвет этого периода связан с памятниками, объединенными в пазырыкскую археологическую культуру скифского типа. Они известны на всей территории Горного Алтая — это знаменитые Пазырыкские, Башадарские, Туектинские, Шибинские, Уландрыкские, Укокские курганы, а также тысячи других. Находки в этих курганах носили сенсационный характер! Кроме могильников, к периоду железа относят такие археологически объекты, как стелы, петроглифы, оросительные сооружения, поселения.

Памятники тюркского периода Горного Алтая до недавнего времени были почти не исследованы. К числу исследованных относят: Верх-Уймон, Курайка, Айрыдаш, Туекта и другие. К тюркскому времени относятся также знаменитые памятники рунической письменности, которых в Горном Алтае обнаружено уже около ста. Они написаны на трех рунических алфавитах. К этому периоду принадлежит значительное число петроглифов, выполненных в технике выбивки и граффити. Одно из последних археологических открытий в Горном Алтае — комплекс из сотен наскальных рисунков — петроглифов, древнейшие из которых дотируются 8 тыс, расположенный в урочище Калбак-Таш, который можно увидеть, путешествуя по Чуйскому тракту.